Dopo la morte di Danzo per mano di Sasuke, Tsunade esce dal coma e torna a essere la quinta hokage. Kabuto propone un'alleanza a Madara, il quale accetta controvoglia, conscio che inimicarsi un ninja così potente potrebbe costargli molto. Nel frattempo Naruto viene segretamente trasferito su un'isola della Nuvola, in modo da evitare di essere coinvolto nella guerra che si sta preparando. Naruto è ignaro dell'imminente conflitto e del reale motivo del suo spostamento, ma sull'isola potrà allenarsi assieme a Killer Bee per controllare la Volpe a Nove Code, passo che ritiene indispensabile per poter fronteggiare Sasuke. Dopo un inizio poco incoraggiante, Naruto riesce a ottenere la collaborazione di Killer Bee, che ora lo aiuterà a domare l'Enneacoda.
