La necessità di un raccordo tra Regione ed enti locali che permetta loro di "fare sistema" ha condotto alla istituzione di un nuovo organo regionale necessario, il Consiglio delle autonomie locali. Definito espressamente come organo di consultazione, esso è stato variamente disciplinato dagli Statuti e dalle leggi regionali che, coinvolgendolo nel procedimento legislativo, hanno evidenziato la natura politica della sua azione. Il Consiglio delle autonomie, istituito in tutte le Regioni presso il Consiglio regionale, supera il precedente "modello delle conferenze" assolvendo ad una più compiuta funzione di rappresentanza delle istanze locali.
