La storia inizia quando Blythe Baxter e suo padre si trasferiscono a Downtown City, in un condominio sopra un negozio chiamato Littlest Pet Shop. Un po’ per caso, Blythe scopre di essere in grado di capire e parlare con gli animali del negozio, così come con gli altri animali della città. Lei e gli animali del Pet Shop vivranno diverse avventure insieme, e quando il negozio rischierà di venire chiuso, questi chiederanno aiuto proprio a Blythe per salvarlo.
